从国家基因组科学数据中心（NGDC）下载测序数据

从国家基因组科学数据中心（NGDC）下载测序数据-Aspera命令行下载

网址如下：https://ngdc.cncb.ac.cn

首先用邮箱注册一个账号，最好是教育邮箱

要下载的数据： https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/browse/HRA002051 页面有数据下载还有样本信息

HTTPS网页端下载

点进去可以下载，但是每个样本的fastq文件太大了，还是换一种方式吧

使用FTP下载数据

方法参考官方手册：https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/document/GSA-Human_Request_Guide_for_Users_cn.pdf

这里使用XFTP，选择“新建”，弹出新建会话属性页面;名称随便，主机名称为human.big.ac.cn；协议改成FTP

取消勾选匿名登录，输入NGDC注册时的用户名和密码

显示用户身份验证失败，虽然手册中提到有的数据需要PI才能下载，但是我们这个数据是Open Access的，奇怪，换一种方式吧

使用Aspera命令行下载

IBM Aspera 是一项革命性的高速文件传输技术。它使用FASP®（Fast Adaptive and Secure Protocol）协议，非常适用于传输大型的文件。相较于FTP、HTTP等，其速度在传输超大文件或远距离传输时更快。

windows安装Aspera Connect

下载软件：https://downloads.asperasoft.com/connect2/

选择IMB Aspera Connect，然后选择默认目录下载

使用参考：https://blog.csdn.net/qq_40905198/article/details/101909201

记录在电脑里的安装位置：C:\Program Files\IBM\AsperaConnect\bin

找到之后重命名，去掉Aspera Connect的空格

NGDC下载页面的指引

点击“数据下载”栏的 Aspera命令行旁边的“帮助”，弹窗给出提示

弹窗提示

点击 Get the key file获得密钥文件

导入密钥文件

参考：https://www.jianshu.com/p/166f9eb8f741

先下载OpenSSH再导入密钥文件进Aspera；将该文件放入C:\Program Files\IBM\AsperaConnect\etc文件夹中（前面的路径不一定一样，但是找到AsperaConnect的安装路径下的/etc就好了）

运行ascp.exe

win+R 输入cmd ，先cd 定位到AsperaConnect的安装路径，然后运行ascp.exe

检查密钥，依旧改成我们自己放的/etc目录：这里是C:\Program Files\IBM\AsperaConnect\etc

输入type “C:\Program Files\IBM\AsperaConnect\etc\aspera01.openssh”

下载文件：

官方给的参考是

[path/to/ascp] -P33001 -i [path/to/key/file] -QT -l100m -k1 -d aspera01@download.cncb.ac.cn:gsa-human/HRA002051 /your/local/path

[path/to/ascp]：替换为ascp可执行文件的完整路径；

[path/to/key/file]：替换为用于身份验证的私钥文件的路径；

[/your/local/path]：文件保存路径

因此我们这里的路径就替换成如下，可以先准备一个txt文件再慢慢粘贴，注意引号

C:\Program Files\IBM\AsperaConnect\bin\ascp.exe -P33001 -i "F:\Work\SLN_Public\LNdataset\CaImImther2023\NGDCkey\aspera01.openssh"  -QT -l100m -k1 -d aspera01@download.cncb.ac.cn:gsa-human/HRA002051 "F:/Work/SLN_Public/LNdataset/CaImImther2023/data/"

由于我们之前已经进入C:\Program Files\IBM\路径了，前面的部分可以省略

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